Les cours Aqua sont excellents pour améliorer son endurance et sa force musculaire en raison de la résistance de l'eau. Dans un milieu aquatique, l'organisme ne pèse plus qu'environ un tiers de son poids sur terre, ce qui facilite les exercices. L'environnement aquatique induit une augmentation de la résistance par rapport à l'environnement terrestre, ce qui contraint les muscles à travailler davantage. La dépense calorique dépend bien entendu de l'intensité à laquelle le participant effectue les exercices, toutefois elle est globalement supérieure à la dépense énergétique constatée par les mêmes exercices effectués dans l'air. Le contraste n'est pas nécessairement ressenti alors que les effets bénéfiques sont très vite visibles. A l'opposé de la plupart des activités sportives, les risques de contusion en lien avec la pratique des sports aquatiques sont très faibles. L'action de l'eau empêche les chocs, ce qui diminue le risque de courbatures et de déchirures musculaires. De plus, ces activités ne représentent aucun danger pour les structures articulaires étant donné que les contacts avec le sol sont moins traumatisants.